一种肝癌预测模型的构建及应用
本发明涉及一种肝癌预测模型的构建及应用。申请人构建了肝癌的预测模型并进行了验证，结果显示，本申请构建的模型不仅具有很好的普适性，适用于各种生物信息学算法，并且准确性和灵敏度都很高。本申请提供的模型为临床肝癌的诊断奠定基础。
肝癌(hepatocellular carcinoma，HCC)是我国乃至世界范围内最常见的实体恶性肿瘤之一，目前针对肝癌的治疗手段主要包括手术切除、肝移植、射频消融、经肝动脉化疗栓塞术等，肝癌患者的生存期延长，生存质量得到一定改善。然而，由于肝癌起病及进展隐匿，发现时往往己失去手术机会，且复发及转移率仍居高不下，总体预后仍较差。因此，迫切需要寻找新的诊断和治疗方法，尤其是早期诊断，来提高患者的生存质量。
大部分已知的miRNA都是通过cDNA克隆测序发现和鉴定的。该法需要先构建miRNA的cDNA文库，再进行PCR扩增，扩增产物随后克隆到表达载体上测序。Takada开发了一种改进的扩增克隆法(miRNA amplification profiling，mRAP)，mRAP法先在miRNA的3’端连上接头，然后用与接头互补的反转录引物反转录。因为特定的反转录酶具有末端脱氧核苷酸酶活性，一些核苷酸(主要是脱氧胞苷酸)会连接到反转录出的cDNA链的3’末端。当5’端接头与cDNA链的poly(C)粘性末端退火后，加入一对共用引物即可实现对cDNA的PCR扩增。由于mRAP高度灵敏，可以直接用克隆和测序技术检测少量组织中miRNA的表达量。标签序列克隆法是一种在在基因表达系列分析(SAGE)技术的基础上发展了检测效率更高的miRAGE(miRNA SAGE)克隆法，该法通过生成大的串联子，通过单个测序反应可检测多个miRNA，明显提高了检测效率
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赵鑫
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