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一种筛选特征mRNA用于诊断早期肺癌的方法

  • 发布时间: 2024-12-06
预算 双方协商
基本信息
成果方:华北电力大学(保定)
合作方式:技术转让
成果类型:发明专利,
行业领域
生物、医药和医疗器械技术
成果描述

本发明公开了一种通过非相关线性判别分析模型筛选特征mRNA用于诊断早期肺癌的方法。首先对己知肺癌样本和正常样本的mRNA表达数据进行标准化处理,将其作为训练集。然后采用非相关线性判别分析对训练集进行建模,得到每个变量对应的转换矩阵G。将标准化后的待诊断样本作为预测集,将其mRNA表达数据与G矩阵相乘,得到非相关判别矢量值,从而进行肺癌样本的识别诊断。通过每个mRNA对应的G的绝对值大小筛选出特征mRNA,并不断调整筛选阈值以减少mRNA保留数量并更新肺癌诊断ULDA模型,直到预测集诊断准确度开始下降。诊断准确度为100%时,所筛选出的最少数目的mRNA可以作为肺癌诊断的潜在特征生物标记物。

应用范围
癌症的早期诊断与及时治疗是提高癌症患者生存率的最有效途径。但癌症的早期诊断一直是困扰医务人员及相关科研人员的难题。肺癌是当前世界最常见、致死人数最多的恶性肿瘤之一,其发病率、增长速度亦高居各恶性肿瘤之首。肺癌早期症状不明显,目前临床一般通过X射线透视、计算机体层扫描等影像学检查及液体活检等手段,但往往确诊时,患者已经发展到中晚期。由于癌症是一种由于细胞受到致癌因素影响发生基因突变所导致的疾病。正常细胞与癌细胞的基因表达存在差异,因此找到标志着细胞癌变的差异表达基因(标记物),可以作为癌症早期诊断的有效手段。随着高通量测序技术的快速发展及测试价格的下降,获得大量基因表达数据已不是难题。然而如何从庞大且复杂的基因表达数据中提取出癌症相关基因,对现有的数据处理和分析方法提出了挑战。而化学信息学恰恰是一个非常有效的解析途径。已有基于化学信息学方法结合基因表达数据建立偏最小二乘判别分析、支持向量机的模式识别(分类)模型,用于重要特征变量的筛选和癌症的识别。


前景分析
G矩阵元素绝对值的平均值为 定义筛选阈值K,当 时,对应的mRNA被保留带入ULDA模型继续计算,记录诊断准确度。不断提高筛选阈值以减少mRNA保留数量并更新肺癌诊断ULDA模型,直到诊断准确度开始下降。诊断准确度为100%时,筛选出的最少数目的mRNA被确定为诊断肺癌的特征mRNA。


联系方式

  • 联系人:

    李艳坤

  • 联系电话:

    19933576696

  • 通讯地址:

    河北省保定市永华北大街619号

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