本发明涉及农业微生物领域，具体公开了一种枯草芽孢杆菌及其在植物真菌病害防治中的应用。其中，所述菌种的分类命名为枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)，命名为A3，保藏日期为2021年11月22日，保藏号为CGMCC No.23953，保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心，保藏地址为北京市朝阳区北辰西路1号院3号。本发明所提供的枯草芽孢杆菌A3用于病原真菌防治时，具有较广的抑菌谱，在大田试验中对于禾谷镰孢的防治效果良好，既能减轻玉米茎腐病的发病程度，又能增加玉米的产量，改善玉米的质量，并且在取得良好防治效果的同时，不会造成污染，有利于可持续发展。因此，该枯草芽孢杆菌的发现对防治植物真菌病害有着重大意义。