生物、医药和医疗器械技术

本发明提供了一种获得稳定核小体遗传标记的方法及其在降解DNA检验中的应用，其包括以下步骤：（a）对待检测样本进行预处理，获得包含DNA的样品；（b）将样品分组，分别用高、中、低剂量水平的微球菌核酸酶对相应样品进行消化；（c）使用试剂盒提取消化后样品中的DNA，获得核小体核心区DNA；（d）对获得的核小体核心区DNA进行测序，将相同微球菌核酸酶消化水平的两个样本数据使用生物信息学工具DANPOS进行比较，进而筛选出稳定核小体定位信息，（f）获取稳定核小体遗传标记。本发明为高度降解检材的DNA分型提供了一种可靠的新方法。

提升法医物证检验可靠性：该方法通过稳定核小体遗传标记的获取，显著提高降解DNA样本的检出率和分型准确性，为陈旧骨骼、腐败组织等疑难生物检材的司法鉴定提供技术支撑。

拓展古DNA研究深度：克服DNA降解对古人类、灭绝物种基因组研究的限制，为考古学和进化生物学提供高精度遗传信息解析工具。

推动癌症早筛技术创新：利用核小体标记特征检测循环肿瘤DNA（ctDNA），提升低浓度ctDNA的捕获灵敏度，助力液体活检技术发展。

本发明在检测和数据分析过程中尽量避免噪音的干扰，主要措施有(1)精确实验条件，例如MNase的消化水平、切割特点，(2)保证测序方法一致性，例如测序平台，单端还是双端测序，测序深度等，(3)数据分析方法一致性，例如检测核小体峰的算法。最终，我们通过筛选稳定核小体并且去除噪音，获得了高精确度核小体定位信息，进而得到其遗传标记信息。